단일세포 공간 전사체학을 이용한 리보핵단백질(RNP) 복합체의 세포질/핵 내 국소화 동역학 매핑

이 기술은 살아있는 세포의 특정 공간적 맥락(spatial context)에서 다양한 RNP 복합체가 어디에 존재하며 어떻게 움직이는지를 높은 해상도로 추적하는 방법을 제공한다.

방법론적 접근

• 공간 전사체학 플랫폼 활용: {{Visium}} 등 공간 전사체 분석 기술을 기본 프레임워크로 사용하여, 특정 유전자 발현 패턴을 세포의 물리적 위치와 연관시킨다.
• RNP 타겟팅 및 FISH/smFISH: 관심 있는 RNP 복합체 구성 성분(RNA 또는 단백질)을 표적으로 하여, 형광 제자리 혼성화(FISH) 또는 단일분자 FISH(smFISH) 기법을 적용하여 공간적 신호를 얻는다.
• 이미징 및 계측: 고해상도 현미경 이미징과 이미지 처리 알고리즘을 통해, 해당 RNP가 세포 소기관 주변인지 혹은 세포질 내에 자유롭게 존재하는지 등의 국소화 정보를 추출한다.

이를 통해 전사 후 조절 과정에서 발생하는 RNP의 공간적 이동성 및 특정 세포 구조와의 상호작용 메커니즘을 밝혀낼 수 있으며, 이는 유전자 발현 조절의 미세 환경적 측면을 이해하는 데 중요하다. 관련 연구는 단일세포 분석과의 융합을 통해 더욱 심층적인 해석이 가능하다.